非理性式行政行为可能会导致组织内部的政治斗争和利益冲突。这种行为通常是基于个人偏见、情绪或权力欲望，而非基于客观的数据和理性的决策。在组织内部，如果管理者采取非理性式行政行为，可能会引发员工之间的不满和争执，导致内部政治斗争的加剧。此外，非理性的决策往往会损害组织整体利益，引发各部门之间的利益冲突，进而影响组织的整体运作。
管理者在面对决策时，应该尽量避免个人情绪和偏见的干扰，而是要依据客观数据和事实进行分析和决策。建立科学的决策机制和流程，制定明确的绩效评估标准，可以帮助管理者减少非理性行为的出现。此外，建立开放、透明的沟通机制，促进员工之间的合作与信任，也可以减少内部政治斗争和利益冲突的发生。
一个案例是在某公司，由于高层管理者偏爱某个部门领导，而非基于绩效数据和表现来评价员工，导致其他部门的员工感到不公平和不满，引发了内部的政治斗争。最终，公司内部的团队合作和整体绩效都受到了影响。