员工在住院期间要求转院，只要转入医院是正规医院,而且是在本市类，其诊断记录依然可以作为伤残鉴定的依剧；但转院必须依法进行，没有按程序处理的，一般对转院后费用不予报销。
可以转院。职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。如果原先治疗的医院不能达到治疗的效果或者其他原因应该是可以转院的。但是前提是必须得到单位的同意不能私自转院。也要原治医院出具转院证明。
按工伤保险条例的规定，能申请工伤认定。职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
工伤私自转院的后果：
主要是治疗所需的医疗费用可能会不符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准，导致无法从工伤保险基金支付，因此建议受伤职工在签订服务协议的医疗机构就医。
法律依据：
《工伤保险条例》第三十条
职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准，由国务院社会保险行政部门会同国务院卫生行政部门、食品药品监督管理部门等部门规定。
职工住院治疗工伤的伙食补助费，以及经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用从工伤保险基金支付，基金支付的具体标准由统筹地区人民政府规定。