发工资没扣税需要补缴税款。公司有代扣代缴个人所得税的义务，公司履行了代扣的义务，但是没履行代缴的义务，是纳税违法的；税务机关会对企业做出追缴税款的决定，同时，还会要求企业缴纳应扣未扣、应收未收职工工资税款的百分之五十以上三倍以下的罚款。
《税收征收管理法》第六十九条 扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上三倍以下的罚款。 第七十条 纳税人、扣缴义务人逃避、拒绝或者以其他方式阻挠税务机关检查的，由税务机关责令改正，可以处一万元以下的罚款；情节严重的，处一万元以上五万元以下的罚款。
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