村委会未经全体村民同意在征地协议上签字不合法。根据法律规定，征地补偿协议应由征收方与被征收方在协商一致的情况下进行签订，村委会无权代替村民签字，如出现村委会代替签名情况的，当事人可向乡镇人民政府反映。
《民法典》
第九十六条
本节规定的机关法人、农村集体经济组织法人、城镇农村的合作经济组织法人、基层群众性自治组织法人，为特别法人。
《民法典》
第九十七条
有独立经费的机关和承担行政职能的法定机构从成立之日起，具有机关法人资格，可以从事为履行职能所需要的民事活动。
《民法典》
第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。