儿童服用奥司他韦主要的副作用就是胃肠道不适症状，包括恶心、呕吐、腹痛等，另外还可能会有流鼻血、耳痛和结膜炎等症状出现。这些副作用一般只在第一次服药时出现一次，继续服药也可缓解，大多数情况下不需停止治疗。
另外还有一些少见的副作用，如头晕、疲劳、头痛、失眠、眩晕、咳嗽、支气管炎、皮疹、过敏反应、肝胆系统异常等，如果情况严重建议及时到医院检查。
一般副作用的强弱和服药的剂量、个人的体质有关，通常儿童年龄越小、服药剂量越大，越容易出现明显的副作用。所以建议最好在遵从说明书以及医嘱正确用药，并且在服药后保持饮食清淡，尽量减少副作用的发生。